Топас подключение: Блок управления септика Топас, схемы подключения

Фев 13, 1977 alexxlab

Содержание

Блок управления септика Топас, схемы подключения

Сегодня речь пойдет о правильном подключении блока управления септика Топас. Септиков много, а Топас является самым известным среди всех. При своей известности блок управления, здесь проще простого. Но при своей простоте, необходимо понимание как он работает и куда что подключается. Многие владельцы Топасов пытаются самостоятельно обслуживать свой септик Топас, а так же ремонтировать, но не всегда получается это сделать правильно. Например, как подключить блок управления Топас?

Блок управления бывает двух видов

Блок управления для Топас с самотечным выбросом очищенных стоков — с розетками для подключения компрессоров 1 и 2.
Блок управления для Топас с принудительным выбросом очищенных стоков — с розетками для подключения компрессоров 1 и 2, розетка 3 для насоса принудительной откачки.

Раньше блоки управления шли с выносными розетками и не было дополнительной распредкоробки. Сейчас же новый блок управления идет со встроенными розетками и подключается он через распределительную коробку. Этот ход сделан намеренно, блок управления стал пломбироваться, и в случае обращения по гарантии проверяются не сорваны ли пломбы, не лазил ли кто в блок управления и не нарушил работу станции.

Не редко появляются вопросы как правильно подключать блок управления в Топасе. Ниже мы перечислили схемы подключения для каждой модели Топаса.

Схемы подключения блока управления Топас всех моделей

Ниже вы увидите подробные схемы

Что вы узнаете

Схема подключения в блоке управления Топас 5-30 (Пр)

Подключить септик Топас к электричеству очень просто. На самом деле производитель все учел, сделал отдельную распределительную коробку, заводите в нее питание, соединяете стандартными зажимными колодками, все, в септике больше ничего не требуется подключать. Подключаете в доме кабель на автомат, включаете и все работает.

Но если вы по какой то причине заходили залезть в блок управления то готовьтесь встретить паутинку проводов, в которых, по началу, можно заблудиться. От Топас 4 до 30 блок управления очень простой как 3 рубля. Достаточно только понять принцип работы самой станции Топас. К примеру в небольших септиках все управляется за счет поплавкового переключателя, который просто передает питание на розетку 1 и розетку 2 и соответственно на 1 и 2 воздушный компрессор. Таким образом работают 2 цикла переработки стоков.

Вот как эти схемы выглядят.

Схема подключения в блоке управления Топас 40-50 (Пр)

В моделях побольше уже добавляется электромагнитный клапан, задача которого, перенаправлять воздух в разные направления и так же вся суть в работе двух циклов (циркуляция и рециркуляция).

Схема подключения в блоке управления Топас 75 (Пр)

Схема подключения в блоке управления Топас 100 (Пр)

Схема подключения в блоке управления Топас 150

Схема подключения в блоке управления Топас 150 Пр

Схемы управления, на мой взгляд, очень удобные, каждый провод имеет свой цвет, при чем это реальные цвета, к примеру у поплавкового переключателя реально 1 провод черный, 2 синий, 3 коричневый, у поплавка аварийной сигнализации тоже самое (как подключить аварийную сигнализацию к септику Топас). Но если вы умудрились не понять суть работы септика и не получилось разобрать схемы блока управления, задавайте свои вопрос в комментариях или на форуме, будем разбираться и подсказывать вам.

Автор статьи: Сергей Юшков

Задавайте вопросы в комментариях, делитесь своим опытом, так же принимается любая конструктивная критика, готов обсуждать.
Не забывайте делиться полученной информацией с друзьями.

Подключение компрессоров к септику Топас 8

Рекомендации владельцам: 55 самых частых вопросов с ответами по септику Топас

Подключение компрессоров к септику «Топас 8» проводится двумя способами: непосредственно через розетку в распределительной коробке или автоматическое реле, защищающее систему от перегрева. Стандартная схема установки электрооборудования включает ряд этапов:

Выбор места для монтажа. Производитель рекомендует устанавливать компрессор внутри септика, в специально отведенном блоке.

Работа компрессора напрямую связана с аэратором, подключаемым к выходному отверстию электроприбора посредством шланга. Соединение должно быть максимально герметичным, исключая утраты кислорода.

Аэратор следует опустить внутрь емкости, компрессор подключить к розетке.

Емкость с компрессором закрывается крышкой для защиты бактерий и установленных приборов.

Если компрессор не работает при подаче питания, высока вероятность поломки электромагнитов, приводящих в движение мембраны. Правильным решением станет доверить ремонт сервисному центру или заменить компрессор по схеме, аналогичной монтажу. В случае гудения устройства, отсутствия аэрации, нарушена целостность мембраны. Замену элемента проводят в несколько действий:

отключают компрессор от электросети;

выкручивают верхний винт на корпусе агрегата, снимают крышку;

извлекают фильтр;

отсоединяют корпус диафрагмы;

откручивают U-образную гайку;

заменяют диафрагму;

собирают компрессор в обратном порядке.

По завершении ремонтных работ остается подключить компрессор к розетке и запустить септик в работу.

Видео о септике Топас

Устройство котлована и траншеи

Монтаж септика

Какой кабель выбрать для Топас

Дата установки: 18.06.2017

При устройстве автономной канализации Топас необходимо правильно подобрать автомат защиты утечки тока и электрический кабель для подачи питания. Наша компания рекомендует устанавливать универсальные ДИФ автоматы или автомат + узо. Таким образом вы вдвойне защищаете оборудование от поломки.

Подключение

Топас к электросети

Ниже предоставляется схема распайки клемной колодки, подключение топаса к электросети, установка аварийного сигнализации. Как видите все завязано на поплавковом переключателе, который, в зависимости от положения (верх/низ) подает питание на первую или вторую розетку.

Какой Автомат и УЗО подойдет для Топас

Важно! Обязательно при подключении септика Топас устанавливайте УЗО (Устройство защитного отключения). При этом автомат устанавливать тоже нужно перед УЗО. УЗО для Топаса должно быть с параметрами 6А и 30мА, такое узо вовремя отключит питание к Топасу и предотвратит перегорание электрического оборудования и защитит Вас от дорогостоящего ремонта.

Остались вопросы по подключению? Звоните! Поможем!

Руководство по подключение септика Топас

Автономная канализация в частном доме с биоочисткой является незаменимой вещью. Во-первых, частный сектор не всегда подведен к центральной городской канализации. Во-вторых, это позволяет существенно сократить расходы за коммунальные услуги. Септик Топас постоянно пользуется большим спросом и это не удивительно. Ведь все стоки очищаются в среднем на 96%, вода на выходе соответствует всем нормам санитарии. Конструкция простая, в ней разберётся каждый.

Требования и нормы расположения септика Топас на участке

Обратите внимание, что все основные требования указаны в документах СанПин и СНиП. Автономную канализацию устанавливают так, чтобы расстояние до источника чистой воды (колодец, скважина) было примерно 50 м, до природного водоема (озеро, река и т.д.) — 10 метров, до участка соседей не менее 4 метров. Также при установке важно учитывать уже проведенные коммуникации: вода, газ и электричество.

Установка очистительной станции

Специалисты при установке следуют всем указаниям в руководстве, подбирают тщательно модель, чтобы септик соответствовал всем характеристикам земельного участка. Размер котлована зависит от характеристик и параметров очистительного устройства. После того как яма вырыта, в ней устанавливают опалубку и песочную подушку в 15 см. Это сильно влияет на дальнейшую работу станции. Далее прокладывают инженерные сети и выполняется герметизации канализации. Также нужно присоединить электричество и проверить/нормализовать давление.

Что такое септик Топас

Прибор изготавливают из высококачественного пластика. Всего выделено 4 основные камеры. Уровень прочности очень высокий, так как в корпусе нет швов сварки. Крышка также изготовлен из пластика, петли поворотные. Вода очищается в 4 этапа. В каждом отсеке есть перепускной коллектор. За поддержку кислорода в системе отвечают электрические насосы. Купить высококачественный септик Топас вы можете у нас. Мы предлагаем широкий ассортимент и адекватные цены.

Где, когда и зачем нужен септик Топас

Данная очистительная станция позволяет рационально использовать хозяйственные и бытовые стоки в частных домах. Септик очищает воду на 96-98% в любое время года, даже зимой. Параметры очищенной воды соответствуют нормам СанПин.

Как работает автономная канализация

Принцип работы очень простой, но эффективный. Все воды стекают в первый отсек, где жидкость отстаивается. Как только отсек заполнится, вся вода попадает во вторую камеру, где происходит снабжение кислородом. Стоки, перемещаясь из отсека в отсек, проходят фильтрацию от крупного и мелкого мусора. В третьем отсеке биоочистка. А в четвертом вода повторно отстаивается. Таким образом вода очищается на 96-98%.

Преимущества септика:

Качественная очистка воды

Долговечность. Среднее время эксплуатации — 50 лет.

Не издает неприятных запахов и лишних звуков.

Антикоррозийность.

Простой ремонт, детали не тяжело найти и приобрести.

Компактность.

Широкий выбор моделей, что позволяет выбрать устройство, которое будет подходить любой местности и климату.

Морозостойкость.

Недостатки септика:

Не работает без электричества.

Высокая цена.

Работы с грунтом

Если вы не знаете как установить и подключить септик Топас, то обратитесь к специалистам! Котлован на 10-15 см вырывается глубже, нежели высота конструкции самой станции. Это нужно для подушки из песка, которая устраняет все неровности. Ширина также должна быть больше, чтобы без проблем поместить септик.

Расположение и заглубление напрямую зависит от свойств грунта на территории

Если много грунтовых вод, то лучше брать модель из пластмассы. Так как в таком случае будет гарантирована высокая герметичность.

Фиксировать станцию нужно очень крепко, чтобы она не всплыла. Если почва глинистая, то устанавливают песчаный фильтр и различные отводы стоков. Дно перед опусканием септика выравнивают и уплотняют. Иногда достаточно только песка. Но если грунтовые воды совсем рядом, то специалисты делают стяжку из песка и цемента, чтобы защитить септик. Вода может уменьшить срок эксплуатации устройства. Стены укрепляют опалубкой, устраняя тем самым рыхлость. Канализацию укладывают под углом 3%, чтобы стоки без труда попадали в септик. Траншею выстилают песком или щебнем.

Монтажные работы

После подготовки котлована опускается блок станции, и подключаются трубы. Конструкция засыпается спесью из цемента и песка. Это защитит септик от повреждений. Во время засыпания нужно наполнить станцию водой, чтобы нормализовать давление. Блок управления лучше не устанавливать на улице. Целесообразно это сделать в подвале, котельной и пр.

После всей проделанной работы нужно подключить септик Топас и запустить его, чтобы проверить качество работы.

Подключение труб и электричества

Трубы подбираются диаметром в 11,0 см. Уклон труб на каждый метр должен быть до 2,0 см. А оптимальная глубина врезки 70-80 см. Для подключения очистительного устройства к электросети нужно брать ПВС кабель с сечением 3*1,5 кв.мм. Во время работы специалисты используют гофрированную трубу. Она помогает защитить кабель от любых механических повреждений. Установку важно очень крепко зафиксировать! Сверху станция закрывается обычным грунтом, который был выкопан.

Ввод станции в эксплуатацию

Чтобы понять качество работы септика, нужно посмотреть на воду на выходе. Если она прозрачная или слегка мутная (это бывает в самом начале запуска станции), то все установлено правильно и никаких сбоев нет. В основном прозрачная вода становится на 10 день, к этом времени стабилизируется количество активного ила по отношению к количеству поступающих стоков.

Правила эксплуатации и обслуживания станции

Правильное обслуживание и использование влияет на продолжительную работу. Модели бывают разными, но техническое обслуживание не меняется. В септик не должны попадать испортившиеся продукты, стройматериал и хлорсодержащие вещества. Также недопустимо попадание материалов и веществ для машины, резины и другого мусора, который не разлагается. Один раз в месяц нужно очищать фильтр. А раз в 3-4 месяца специалисты должны стабилизировать количество активного ила. Раз год в теплое время года (лучше всего весной) нужно выполнять комплексную чистку (стены, дно, фильтры),заменять мембрану, поплавковый механизм.

Как подключить шланги к форсункам Топаса ( фото) | Канал Септик-Пермь

Внимание! Если вы затрудняетесь в обслуживании септика Топас, рекомендуем обратиться в нашу компанию. Стоимость обслуживания…

Воздухораспределение в септике Топас

Многие обладатели Септика Топас не знают что штуцера, к которым подключаются шланги имеют разные внутренние диаметры. Это сделано для того, чтобы на каждый воздушный насос Топаса подавалось определенное количество воздуха. Штуцера могут быть с соплом от 0,8 до 1,2 мм. Например главный насос имеет диаметр сопла 1 мм и этого диаметра ему достаточно для перекачки стоков из приемной камеры в камеру аэротенка. Обдув главного насоса имеет диаметр сопла 0,8 мм, т.е. небольшой подачи воздуха хватает обдувать главный воздушный насос.

Что будет если перепутать форсунки (штуцера)?

Если при сервисном обслуживании или при других обстоятельствах вы перепутали штуцера и надели шланги не на свои места может произойти следующее: прекратится равномерность подачи кислорода в определенные узлы станции и, к примеру если за пример взять главный насос, если вы подсоедините его шланг к штуцеру с меньшим диаметром сопла, тогда он не будет выдавать заданных характеристик перекачки залпового сброса, а еще хуже, это может привести к затоплению оборудования. Поэтому, обращайте внимание на подключение к штуцерам, в этом вам поможет памятка.

Памятка подключения шлангов к штуцерам Топас

1 цикл работы Топас (поплавок вверху)

В данном 1м цикле происходит перекачка жидкости:

главный насос — из приемной камеры в камеру аэротенка
обдув фильтра грубой очистки
циркуляционный насос — перекачивает жидкость из камеры аэротенка в успокоитель
насос откачки ила — производит аэрацию в камере стабилизации ила
аэратор аэротенка — аэрирует жидкость в аэротенке (проще говоря подается воздух на самое дно септика и через мембрану с мелкими отверстиями подается воздух, таким образом жидкость подпитывается кислородом и создает завихрения на дне и не позволяет бактериям прессоваться на дне.

2 ЦИКЛ РАБОТЫ ТОПАС (ПОПЛАВОК внизу)

Во 2м цикле происходит перекачка жидкости:

насос аэротенка (насос рециркуляции) — перекачивает жидкость из камеры аэротенка в камеру стабилизатор ила. Его задача снижать концентрацию ила в камере аэротенка. В дальнейшем при обслуживании септика лишний ил откачивается
жироудалитель — собирает пленку жира в успокоителе и перекачивает ее в камеру аэротенка для повторной переработки
обдув успокоителя — создает направление потока к жироудалителю
аэратор аэротенка — аэрирует жидкость в приемной камере.

Станция Топас-С 8 — от официального дилера, низкие цены

Особенности

В моделях Топас установлено два компрессора, функционирующих попеременно и обеспечивающих работу первого и второго циклов очистки. Модели Топас-С снабжены только одним компрессором, который работает постоянно и подает воздух через специальный распределительный клапан. В остальном конструкция и принцип работы УОСВ Топас-С такие же, как и в моделях Топас. Данное техническое решение не оказывает негативного влияния на качество очистки сточных вод, которое по-прежнему остается на очень высоком уровне.

Преимущества:

Энергопотребление на уровне
100-ваттной лампочки
Не требуется откачка
Обслуживание – раз в 3-6 месяцев
Производительность – до 1500 л/сут

Описание

Автономная канализация «ТОПАС» отличается своей универсальностью: каждая из моделей предназначена для конкретной сферы эксплуатации. В частности, септик топас 8 эффективно используется в загородных коттеджах с круглогодичным проживанием или сезонным пребыванием людей.
Биоустановка рассчитана на обслуживание восьми человек с одномоментной переработкой залпового сброса до 440 литров.
Герметичный корпус станции изготовлен из прочного полипропилена, а вспененный слой предохраняет от промерзания. Модель обладает прямоугольной формой и состоит из четырех камер:

приемной для первичной очистки;
аэротенка для интенсивной очистки;
вторичного отстойника для полного осветления стоков;
стабилизатора активного ила для утилизации отработанного биоматериала.

Принцип функционирования биостанции очистки Топас 8 основывается на использовании аэробных бактерий.

Модификации

В зависимости от типа почв и глубины прокладки канализационной системы можно выбрать соответствующую модель:

Топас 8 Пр – осуществляет принудительный отвод очищенных стоков.
Топас 8 Лонг – для подключения обвязки на глубине свыше 80 см.
Топас 8 Лонг Пр – позволяет подключать канализационные трубы на глубине свыше 80 см и осуществляет принудительный отвод очищенных стоков.

Установка

Установка под ключ квалифицированным персоналом — это залог гарантированного срока эксплуатации в 50 лет!

Топас 8 имеет компактные размеры, поэтому монтаж прост и малозатратен. Размещать станцию можно практически везде, ей достаточно чуть больше квадратного метра площади, герметичный корпус не пропускает в атмосферу неприятных запахов или шумов.

Этапы установки под ключ:

Подготовка места и создание котлована
Установка септика
Обустройство канализационной системы
Герметизация обвязки

Септик Топас 20 до 20 человек, цены от официального дилера в Москве

Автономная канализация Топас 20

Для небольших пищевых предприятий, столовых, ресторанов или гостиниц в качестве устройства для очистки стоков оптимально подойдет станция Топас 20 и её разновидности.

Независимая установка может применяться в случаях, когда число потенциальных пользователей не больше 20-ти человек. Такой септик актуален также для небольших объектов – пансионатов, баров.

Принципы работы септика

Данная конструкция имеет высокую производительность и очищает загрязнённую воду до 98% посредством сочетания 2-ух способов – механического отстаивания и обработки с помощью микроорганизмов. В установках биоочистки применяются устройства, наполняющие кислородом окружающую среду.

Аэраторы содействуют созданию благоприятной среды, для активного размножения бактерий, которые быстро и в полном объёме перерабатывают органические вещества. Корпус установки состоит из 4-х резервуаров-отстойников. В роли гидравлического фильтра выступает органический ил, представляющий собой колонии микробактерий.

Модификации и технические параметры септика до 20 человек

Наружный корпус установки выполнен из прочного пластика. Расстояние между внутренней и наружной стенками заполнено вспененным полипропиленом. Данный наполнитель характеризуется высоким коэффициентом прочности и защищённости от перепадов температуры, что способствует стабильной и длительной работе септика.

Очистная система производится в 4-х вариантах со схожими показателями производительности, но имеющими конструктивные отличия. Правильный выбор модели зависит от определённых монтажных требований:

Классический вариант установки Топас 20 представляет собой модификацию, в которой стоки, проходящие многоступенчатый процесс очистки, двигаются самотёком. Данная разновидность подразумевает подключение канализационной трубы на уровне не глубже 0,8 м от поверхности. Рекомендуется применение в песчаных грунтах, торфяниках и пр.

Вариант с отведением очищенной воды при помощи гидронасоса. Обозначается «Пр». Установка такой системы целесообразна при отсутствии возможности самостоятельного отвода. Её нужно устанавливать при наличии повышенных слоёв залегания грунтовых вод, а также в глинистых почвах. В комплекте с такой моделью идет специальная емкость для сборки воды и погружной электронасос.

Если выход канализационной трубы находится ниже, чем предусмотрено по схеме установки стандартной модификации, оптимальным выбором будет система Топас 20 Long. В этом варианте подключение может выполняться на глубине до 1,4 метра.

Есть ещё одна конструктивная модель септика, в которой сочетаются лучшие достоинства 2-ой и 3-ей из представленных модификаций, а именно, установка Топас 20 Long пр, имеющая горловину увеличенной длины и принудительный отвод воды, прошедшей процесс очистки.

Некоторые особенности установки

Монтажные работы отличаются достаточной простотой и отсутствием необходимости в специальных инструментах и оборудовании. Работы проводятся в интервале от 1-го до 2-х дней. Но в силу того, что масса септика составляет 0,5 т., в процессе монтажа целесообразно применение подъемной техники.

TOPAS MC

Добро пожаловать в TOPAS MC Inc. , некоммерческую организацию, которая поддерживает и расширяет инструмент TOPAS для моделирования частиц.

12 августа 2021 г .: Выпущена версия 3.7 TOPAS. Лицензированные пользователи могут видеть подробную информацию на форуме пользователей и в репозитории кода.

TOPAS дополняет и расширяет Geant4 Simulation Toolkit, чтобы сделать расширенное моделирование методом Монте-Карло всех форм лучевой терапии более простым в использовании для медицинских физиков. TOPAS может моделировать лечебные головки с рентгеновскими лучами и частицами, моделировать геометрию пациента на основе изображений КТ, оценки дозы, плотности потока энергии и т. Д., сохраняет и воспроизводит фазовое пространство, предоставляет расширенную графику и является полностью четырехмерным (4D), чтобы обрабатывать изменения в доставке луча и геометрии пациента во время лечения. Пользователи TOPAS конфигурируют предварительно созданные компоненты (такие как сопла, геометрия пациента, компоненты дозиметрии и визуализации) для моделирования широкого спектра лучевой терапии без обязательного знания базового набора инструментов Geant4 Simulation Toolkit или какого-либо языка программирования. Все аспекты моделирования, включая поведение в 4D, контролируются с помощью уникальной системы управления параметрами TOPAS.TOPAS был разработан с нуля, чтобы быть гибким, но простым в использовании, надежным и воспроизводимым. В коде большое внимание уделяется безопасности «на месте», в нем используются различные методы, чтобы пользователям было сложнее совершать ошибки.

TOPAS дополнительно описан в рукописи открытого доступа: Perl J, Shin J, Schumann J, Faddegon B, Paganetti H. TOPAS: инновационная протонная платформа Монте-Карло для исследований и клинических приложений. Med Phys. 2012 ноя; 39 (11): 6818-37. (Просмотр: PubMed).
Эта рукопись была процитирована 555 раз в Google Scholar.

Базовые концепции TOPAS были первоначально созданы в результате финансируемого NIH сотрудничества Национальной ускорительной лаборатории SLAC, Массачусетской больницы общего профиля и Калифорнийского университета в Сан-Франциско. После бета-тестирования сообществом пользователей в 88 учреждениях Стэнфордский университет предоставил TOPAS MC Inc. лицензию на защищенное авторским правом ядро TOPAS, чтобы мы могли распространять TOPAS среди конечных пользователей и собирать лицензионные сборы для финансирования дальнейшей разработки и поддержки пользователей.По последним подсчетам, у нас был 1751 лицензированный пользователь в 508 учреждениях в 52 странах.

В то время как самые ранние применения TOPAS были в протонной терапии, TOPAS теперь доступен для использования во всех областях исследований лучевой терапии, а также подходит для некоторых приложений медицинской визуализации. Продолжается работа по распространению TOPAS на радиационную биологию и естественнонаучное образование. Другие потенциальные приложения включают исследования радиационного повреждения электроники, физики элементарных частиц, ядерной физики и астрофизики.

Наша миссия — превратить TOPAS в инструмент, который удобно поместится в руках каждого медицинского физика.

Стоимость лицензии на одного пользователя варьируется от бесплатной до 2500 долларов США. в зависимости от класса пользователя. См. Подробности в разделе «Типы лицензий».

TOPAS MC Inc. является некоммерческой общественно полезной корпорацией и признана IRS в качестве освобожденной от налогов общественной благотворительной организации в соответствии с разделом 501 (c) (3).

Политика конфиденциальности | TOPAS

Политика конфиденциальности веб-сайта

Auf Deutsch

Спасибо, что посетили сайт TOPAS.Мы хотели бы предоставить вам ценную информацию о наших продуктах. Мы серьезно относимся к защите ваших личных данных и хотим, чтобы вы чувствовали себя комфортно при посещении нашего веб-сайта. Наши сотрудники обязаны соблюдать конфиденциальность данных и регулярно проходить обучение принципам защиты и безопасности данных. Ниже мы хотели бы вкратце рассказать вам, как мы защищаем ваши данные и что означает для вас использование наших онлайн-предложений. Мы, конечно же, соблюдаем правовые требования Общих правил защиты данных (GDPR) и Федерального закона Германии о защите данных (BDSG), а также других законов о защите данных.

Ниже приводится подробная информация о защите данных в нашей компании.

I. Причины сбора данных

Мы собираем и обрабатываем ваши данные, чтобы сделать наш веб-сайт доступным для вас и предоставить вам лучший сервис благодаря удобному доступу к нашим услугам.

II. Какие данные собираются, обрабатываются или используются?

a) Посещение нашего веб-сайта: Когда вы заходите на наш веб-сайт, наши серверы автоматически собирают общую информацию, в частности, с целью установления соединения, а также обеспечения функциональности и безопасности системы.Это включает в себя тип используемого браузера, используемую операционную систему, доменное имя интернет-провайдера, данные подключения используемого компьютера (IP-адрес), веб-сайт, с которого вы посетили наш сайт (URL-адрес реферера), веб-страницы, которые вы посещаете. посещение на нашем сайте, поисковый запрос, если вы пришли на наш сайт через поисковую систему, файлы, которые вы загрузили с нашего сайта (например, документы PDF или MSWord), а также дату, время и продолжительность вашего посещения. Мы не можем отследить эти данные до конкретных людей из-за процесса псевдонимизации.Эти данные не объединяются с другими источниками данных. Правовой основой для обработки ваших персональных данных является ст. 6 п. 1 лит. f GDPR.

b) Контактная форма: Если вы связываетесь с нами через контактную форму и хотите связаться с нами по электронной почте, вы должны предоставить нам свое имя и фамилию, адрес электронной почты и ваше сообщение. Мы сохраняем эти данные для обработки вашего запроса и на случай возникновения дополнительных вопросов. Мы не передаем эти данные за пределы TOPAS Advanced Polymers и Polyplastics без вашего согласия.Правовой основой для обработки ваших персональных данных является ст. 6 п. 1 лит. f GDPR.

III. Удаление

Личные данные удаляются или доступ к ним ограничивается, как только цель их сохранения больше не актуальна или вы запрашиваете их удаление. Данные также удаляются, если срок хранения, указанный в соответствующем стандарте, истек, за исключением случаев, когда это требуется, они остаются сохраненными для заключения или выполнения контракта или если вы дали на это согласие.

IV.Печенье

Файлы cookie

используются для приятного оформления веб-сайта и учета предпочтений посетителей веб-сайта. Например, это означает, что ваш выбор страны или языка сохранен. Файлы cookie — это текстовые файлы, сохраняемые на вашем жестком диске, которые вызываются при повторном посещении веб-сайта для идентификации вашего браузера.

Вы можете отключить сохранение файлов cookie на жестком диске, выбрав соответствующие настройки браузера. Уже сохраненные файлы cookie можно удалить в любой момент.Пожалуйста, обратитесь к соответствующему руководству по браузеру, чтобы удалить файлы cookie и предотвратить их сохранение. Если вы не принимаете файлы cookie, это может ухудшить работу нашего веб-сайта.

Правовой основой для обработки файлов cookie является ст. 6 п. 1 лит. f GDPR. Наша обоснованная заинтересованность в использовании файлов cookie основана на желании создать привлекательный веб-сайт и оценить поведение пользователей с целью улучшения нашего веб-сайта. Некоторые функции нашего веб-сайта недоступны без использования файлов cookie.Для этого также необходимо, чтобы браузер снова распознавался после переключения страниц.

V. Безопасность данных

С помощью технических и организационных мер мы защищаем наш веб-сайт и другие системы от потери, уничтожения, доступа, изменения или распространения ваших данных неуполномоченными лицами. Несмотря на регулярные проверки и постоянное совершенствование наших мер безопасности, постоянная защита от всех рисков невозможна.

VI. Автоматизированное принятие решений

Автоматическое принятие решений, включая профилирование, на основе предоставленных вами данных не происходит.Вы не обязуетесь предоставлять нам свою личную информацию. Если вы возражаете, мы не сможем частично обработать указанные ниже услуги.

VII. Google Реклама

На нашем веб-сайте используется отслеживание конверсий Google. Если вы пришли на наш веб-сайт через рекламу, размещенную Google, на вашем компьютере будет сохранен файл cookie с помощью Google Рекламы. Файл cookie для отслеживания переходов устанавливается, если пользователь нажимает на рекламу, размещенную Google. Эти файлы cookie становятся недействительными через 30 дней и не используются для личной идентификации.Если пользователь посещает определенные страницы на нашем веб-сайте и срок действия этого файла cookie еще не истек, мы и Google можем увидеть, что пользователь нажал на рекламу и был отправлен на эту страницу. Каждый клиент Google Рекламы получает разные файлы cookie. Таким образом, файлы cookie не могут отслеживаться веб-сайтами клиентов Google Рекламы. Информация, собранная с помощью файла cookie конверсии, используется для создания статистики конверсии для клиентов Google Рекламы, которые выбрали отслеживание конверсий. Клиенты получают общее количество пользователей, которые нажали на их рекламу и были отправлены на страницу с тегом отслеживания переходов.Однако они не получают никакой информации, с помощью которой можно было бы идентифицировать пользователей.

Если вы не хотите участвовать в отслеживании, вы можете отказаться от установки необходимого для этого файла cookie, например, через настройку браузера, которая обычно деактивирует настройку файлов cookie, или установив настройку браузера, которая блокирует файлы cookie из домена. «googleleadservices.com». Обратите внимание, что вы не должны удалять файлы cookie отказа, если не хотите, чтобы ваши данные регистрировались.Если вы удалили все свои файлы cookie в браузере, вам необходимо снова установить соответствующий файл cookie отказа.

VIII. Ремаркетинг

Наш сайт использует сторонние сервисы ремаркетинга для предоставления рекламы наших материалов. Эти службы могут использовать определенные веб-технологии, включая файлы cookie, веб-маяки, прозрачные гифки и пиксели (совместно именуемые «файлы cookie и другие технологии») для предоставления этих услуг. Эти файлы cookie и другие технологии не идентифицируют вас лично, но предоставляют техническую и поведенческую информацию, такую как IP-адрес, тип устройства, тип браузера и идентификатор устройства, используемые для посещения веб-сайта, дату и время вашего посещения, страницы, которые вы просматриваете. , веб-сайты, которые вы посетили до и после посещения этого сайта, какие электронные письма и рекламные объявления вы получали и как вы с ними взаимодействовали, какие виды поисков в Интернете вы выполняли и (если это разрешено вашим устройством) данные о местоположении. Наши поставщики услуг используют данные из этих файлов cookie и других технологий, чтобы предоставить нам информацию, как указано выше.

Что такое веб-маяки, четкие гифки и пиксели? — это три названия одной и той же технологии: маленькое или невидимое изображение или другой загружаемый элемент, который может работать независимо или с файлами cookie для записи определенной технической или поведенческой информации о том, был ли доставлен и открыт или просмотрен определенный контент.

Не отслеживать — Наши службы и сайты в настоящее время не распознают сигналы «Не отслеживать», которые могут быть отправлены некоторыми браузерами.

Взаимодействие между устройствами — Если вы используете различные устройства для доступа к соответствующим веб-сайтам или службам, наши файлы cookie и другие технологии могут использовать автоматический анализ, чтобы попытаться сопоставить ваш анонимный профиль на различных устройствах. Это позволяет нашим поставщикам лучше обслуживать рекламные объявления, которые могут вас заинтересовать, а также может помочь нам предотвратить просмотр одной и той же рекламы на различных устройствах.

Как используется и передается техническая и поведенческая информация? — Наши поставщики используют техническую и поведенческую информацию, полученную из файлов cookie и других технологий на наших веб-сайтах, чтобы отличать вас от других потребителей, чтобы ваш «опыт» был доступен только вам.В некоторых случаях мы и наши партнеры также используем файлы cookie, чтобы вы не видели ненужную рекламу, чтобы вам не приходилось входить в систему больше, чем это необходимо для безопасности, и не забывать о сохраненных вами настройках. Файлы cookie в сочетании с файлами журналов нашего веб-сервера и нашими поставщиками позволяют нам подсчитать общее количество людей, посещающих наш веб-сайт, и какие части сайта являются наиболее популярными. Это помогает нам собирать отзывы, чтобы постоянно улучшать наш веб-сайт и лучше обслуживать наших клиентов.

Наши поставщики используют техническую и поведенческую информацию, полученную из файлов cookie и других технологий на нашем веб-сайте, для автоматического создания анонимных поведенческих профилей. Наши поставщики также могут использовать техническую и поведенческую информацию, полученную из сторонних источников, для создания этих профилей. Эти профили не идентифицируют вас лично, но позволяют нашим поставщикам показывать рекламу, которая с большей вероятностью будет вам интересна или актуальна (реклама на основе интересов), включая рекламу наших материалов.Наши поставщики могут делиться с нами технической и поведенческой информацией и профилями поведения в рамках работы с ними, чтобы определить, какие виды рекламы на основе интересов размещать и где.

IX. Права заинтересованных лиц

a) Информация, отключение, исправление, ограничение и удаление: Если ваши личные данные обрабатываются, вы являетесь заинтересованным лицом в соответствии с GDPR, и вы имеете право запросить информацию о ваших данных, сохраненных у нас. Кроме того, у вас есть право на исправление, отключение, ограничение обработки и / или удаление ваших данных.Если вы заявили о своем праве на исправление, удаление или ограничение обработки, мы обязаны сообщить — всем получателям, которым были раскрыты ваши личные данные, — об этом исправлении или удалении данных или ограничении их обработки, если это не окажется невозможным или связано с необоснованными усилиями. Вы имеете право получать информацию об этих получателях.

b) Право на переносимость данных: Вы имеете право получать персональные данные о вас, которые вы нам предоставили, в структурированном, актуальном и машиночитаемом формате.

c) Право на возражение: Вы имеете право в любое время возразить против обработки ваших персональных данных, которая имеет место в соответствии со ст. 6 п. 1 лит. д) или е) GDPR. Мы больше не будем обрабатывать касающиеся вас персональные данные, если мы не сможем доказать веские причины, заслуживающие защиты для их обработки, которые перевешивают ваши интересы, права и свободы, или если обработка служит для утверждения, исполнения или защиты юридических требований.

d) Право на возражение против Заявления о согласии в отношении правовой защиты данных: Вы имеете право в любое время отозвать свое заявление о согласии по защите юридических данных.Отзыв согласия не повлияет на законность обработки, которая имела место в результате согласия до момента отзыва.

e) Право на подачу жалобы в регулирующий орган: Невзирая на другие административные или юридические средства защиты, вы имеете право подать жалобу в регулирующий орган, особенно в государстве-члене, в котором вы находитесь или проживаете, ваше рабочее место или местонахождение предполагаемого нарушение, если вы считаете, что обработка ваших персональных данных нарушает GDPR.Регулирующий орган, в который была подана жалоба, должен проинформировать заявителя о статусе и результатах жалобы, включая возможность правовой защиты в соответствии со ст. 78 GDPR.

X. Ответственные стороны

Орган, отвечающий за GDPR и BDSG:

TOPAS Advanced Polymers GmbH
Am Prime Parc 9
65479 Raunheim, Germany
tel: +49 (0) 1805-1-86727
email: info [at] topas. com
Интернет: https: // topas.com

Управляющие директора: Грегор Боммель, Франк Кауэрц

Сотрудник по защите данных: Фолькер Ацподин

TOPAS Advanced Polymers GmbH
Beauftragter für den Datenschutz
Am Prime Parc 9
65479 Raunheim, Germany
электронная почта: datenschutz (at) topas.com

TOPAS Advanced Polymers GmbH и Polyplastics USA, Inc.
Действительно с августа 2020 г.

TOPAS-Academic

Введение

Technical_Reference.pdf

теперь доступен:

1) Учреждения, присуждающие ученые степени, в состав которых входят университеты,
университетские институты, лаборатории и школы.

2) Центры синхротронных и нейтронных исследований.

TOPAS-Academic включает в себя все функциональные возможности
BRUKER-AXS TOPAS
работает в Launch
режим, включающий всю графику, а также редактор и программу просмотра структуры OpenGL.В режиме запуска реализована полная функциональность TOPAS.

*** Использование TOPAS-Academic требует компьютерной грамотности ***

Что нового New7.pdf

Что такое TOPAS-Academic

Система компьютерной алгебры для минимизации функций и применения линейных / нелинейных ограничений.

Полнофункциональная программа Ритвельда для лабораторной дифракции рентгеновских лучей, синхротронных, монокристаллических и нейтронных данных с фиксированной длиной волны и данных TOF.

Алгоритм моделирования отжига для всех систем, включая решение конструкции
в реальном космосе по порошковым, нейтронным, нейтронным данным TOF и монокристаллам.

Программа командной строки под названием TC.EXE, которая включает ядро TA; используется для пакетной обработки.

Учебники, описывающие функциональные возможности TOPAS-Academic, любезно предоставленные Джоном Эвансом, можно найти
здесь.

Кто это на

Вход в TOPAS-Academic — Написание сценариев INP

Редакторы — это личный выбор, и было бы неразумно ожидать, что все пользователи согласятся на какой-то конкретный. Однако в
усилия по стандартизации редактирования файлов INP и поощрение использования хорошего редактора и обмена
редактор macors редактор с открытым исходным кодом jEdit
(под лицензией GNU General Public License, GNU GPL)
Рекомендовано.

Сотрудничество с Джоном Эвансом и TOPAS Wiki

Участие Джона Эванса в TOPAS-Academic продолжается с неизменной поддержкой. Его многочисленные идеи, предложения, руководства и тщательное тестирование привели к множеству прорывов и улучшений.

TOPAS-Academic / Сравнение TOPAS

Нет различий между ядром TA и Bruker-AXS TOPAS для одного и того же номера версии.TA всегда будет включать последнее ядро.

Нет никаких различий в отношении измельчения монокристалла, решения структуры, нейтронного времени пролета и нестандартного измельчения Ритвельда.

Существуют некоторые различия в том, как вводятся данные для подгонки пиков, как показано в учебных пособиях.
здесь.

Для стандартного уточнения Ритвельда TOPAS предлагает использование диалогов Windows.

Индексирование отличается, но в целом похоже — снова см. Учебные пособия
здесь.

Цены — лицензии на один компьютер / пользователя на уровне отделов

Версия 7

1600 евро за первую лицензию
550 евро за каждую дополнительную лицензию

Обновление версии 6 до версии 7 и начало с самой старой

100 евро при покупке в течение последних 3 месяцев
300 евро при покупке в течение последних 6 месяцев
400 евро при покупке в течение последних 12 месяцев
700 евро при покупке в течение последних 24 месяцев
1000 евро при покупке до последних 24 месяцев

Для дополнительных лицензий

50 евро при покупке в течение последних 3 месяцев
100 евро при покупке в течение последних 6 месяцев
150 евро при покупке в течение последних 12 месяцев
250 евро при покупке в течение последних 24 месяцев
400 евро при покупке до последних 24 месяцев

Плата может взиматься за передачу лицензии по причинам обновления компьютера после первоначального двухлетнего периода.

Поддержка

Поддержка по предлагаемым методикам и работе программы предоставляется по электронной почте.тем не мение
полное решение проблем, требующих иногда нескольких дней работы, не поддерживается; это консалтинг
и с клиентов будет взиматься соответствующая плата.

Закупка

Покупателю высылается счет-фактура.
Покупатель платит банковским переводом или кредитной картой. Реквизиты австралийской компании можно получить на веб-сайте правительства Австралии, используя номер австралийской компании, указанный в верхней части этой страницы.

Благодарности

Джон Эванс для
постоянная поддержка, тестирование и руководство по развитию функциональности ТА.

Краткий обзор функциональных возможностей версии 7

История

Скелеты

Вспомогательные программы

Пожалуйста, не скачивайте

Если у вас есть вопросы, пишите AlanCoelho @ bigpond.ком

Пример коммутационного блока SYS 520 | Topas GmbH

Системы отбора проб / аэрозольные вещества / осушитель

Блок переключения проб SYS 520 был разработан для определения эффективности фракционного разделения фильтров или фильтрующих материалов в двух разных точках отбора проб, то есть до и после фильтра.
Эта задача может быть реализована с помощью блока переключения проб SYS 520 только с одним анализатором размера частиц, экономично и воспроизводимо. С помощью блока переключения возможен автоматизированный и безопасный обмен между измерениями линий отбора проб I, II и линией отбора проб программы продувки (с использованием встроенного HEPA-фильтра).

Переключение между разными точками отбора проб
Определение кривых относительной эффективности
Защита от высокого содержания частиц в устройстве для измерения частиц путем временного ограничения потока пробы
Возможность переключения образцов в труднодоступных местах

SYS 520 предназначен для прямого подключения к лазерному спектрометру размера частиц аэрозоля LAP 322.

Модели SYS 520 / P и SYS 520 / H интегрированы в решения для испытательных стендов и имеют аппаратный интерфейс, который передает сигналы управления и обеспечивает подачу питания.

Модель SYS 520 / S предназначена для использования с различными устройствами измерения частиц, такими как счетчик частиц для воздуха и газов LAP 340. Управление устройством через порт последовательной связи (RS 232) с помощью компьютера.

С помощью программного обеспечения для анализа и управления PASWin или программного обеспечения для испытательных стендов фильтров PAFWin можно легко вручную или автоматически переключаться между двумя линиями отбора проб.

	SYS 520, SYS 520 / P	SYS 520 / H, SYS 520 / S
Блок питания	24 В постоянного тока	24 В постоянного тока
Адаптер переменного тока	100… 240 В переменного тока / 24 В постоянного тока	100… 240 В переменного тока / 24 В постоянного тока
Пробоотборные трубки	4,7 мм x 3,4 мм (Tygon-Silicone)	9. 6 мм x 6,4 мм (Tygon-Silicone)
Размеры (ВхШхГ)	200 мм x 160 мм x 130 мм	210 мм x 300 мм x 150 мм
Вес	1,8 кг	3,1 кг

Прямоугольный пробоотборный зонд SYS 529 | Topas GmbH

Системы отбора проб / аэрозольные вещества / осушитель

ISO 14644-3

Изокинетические пробоотборные зонды требуются, например, для проверки герметичности встроенных систем фильтрации в чистых и чистых помещениях.В существующих стандартах и руководствах рекомендуются зонды с прямоугольным поперечным сечением.

Зонды Topas имеют прямоугольное поперечное сечение в точке всасывания, которое равномерно переходит в круглое поперечное сечение для шлангового соединения. Производственный процесс гарантирует высококачественную гладкую поверхность внутри зонда, включая все переходы. Конструктивная конструкция датчика основана на международном стандарте ISO 14644-3, а также директиве VDI 2083-3.

скорость счета, не зависящая от местоположения
точное сканирование даже в углах фильтра
низкое время сканирования из-за большей ширины зонда (поперек направления сканирования)

испытание на герметичность встроенных фильтровальных систем

Заглушка
Крышка и фильтр
Антистатическая силиконовая трубка

Отбор проб называется изокинетическим, если скорость потока на выходе из фильтра равна скорости потока на входе в датчик.

Если скорость потока на выходе из фильтра (UF), например, больше, чем скорость потока на входе зонда (US), часть воздушного потока будет обходить зонд. Крупные частицы, в отличие от мелких, не могут следить за изменением воздушного потока и просто улавливаются зондом. Проба фракционируется, а результаты измерений фальсифицируются.

Следовательно, важно, чтобы размеры зонда соответствовали объемному расходу пробы и скорости потока за фильтром, чтобы обеспечить соответствие изокинетическому отбору проб.

материал

корпус зонда
шланговое соединение

анодированный алюминий
нержавеющая сталь

длина

без шлангового соединения
со шланговым соединением

150 мм
230 мм

вес

ок. 170 г

Fluke 1760 3-фазный регистратор качества электроэнергии Topas Tiger Supplies

Выявление возможных проблем в электрической системе затруднительно, трехфазный регистратор качества электроэнергии Topas Fluke 1760 является лучшим решением для быстрого и безопасного мониторинга этих систем.Данное устройство соответствует требованиям стандарта IEC 61000-4-30 Class-A для расширенного анализа качества электроэнергии и последовательного тестирования на соответствие. Fluke 1760 в основном используется для проведения подробного анализа помех, корреляции событий, гальванической развязки, связи по постоянному току и исследований силовой нагрузки.

Этот трехфазный регистратор включает программное обеспечение PQ Analyze, которое представляет собой комплексное приложение, которое предоставляет диаграммы тенденций, статистические сводки, отчеты и мониторинг в реальном времени с использованием онлайн-режима. Он отличается гибкой и настраиваемой операцией, которая позволяет электрикам определять определенные проблемы, определяя подробную основу для обнаружения и регистрации нарушений.Кроме того, он оснащен функцией захвата формы волны на десять мегагерц, 6000 Впик, которая предоставляет данные о любом событии.

Регистратор качества электроэнергии 1760 может похвастаться памятью 2 ГБ, которой достаточно для хранения больших объемов подробных и полных данных. Его можно легко настроить с помощью Plug and Play, что устраняет необходимость в батареях. В качестве дополнительной функции Fluke 1760 имеет прочный изолированный пластиковый корпус и твердотельную конструкцию, которая по-прежнему надежна в использовании даже в суровых условиях.

Варианты конфигурации

Трехфазный регистратор качества электроэнергии Fluke 1760 Topas предлагает четыре пакета с различными функциями, которые соответствуют вашим потребностям.Пожалуйста, выберите из раскрывающегося меню выше.

2630732: Fluke 1760 Basic Recorder
2630759: Fluke 1760 US Version Recorder с пробниками напряжения и двухдиапазонными датчиками тока
2637629: Fluke 1760TR Basic Recorder с быстрым анализом переходных процессов
Fluke 1760TR US Version Recorder с быстрым анализом переходных процессов, пробниками напряжения и двухдиапазонными пробниками тока

Topaz-Denoise: общие модели глубокого шумоподавления для криоЭМ и криоЭТ

Подготовка обучающего набора данных для 2D-моделей шумоподавления

Для обучения моделей шумоподавления , мы собрали большой набор данных кадров микрофотографий из общедоступных репозиториев ³³ и внутренних наборов данных в Центре структурной биологии Нью-Йорка (NYSBC), как описано в дополнительной таблице 3.Эти кадры микрофотографий были собраны при большом разнообразии условий визуализации и содержат данные, собранные на микроскопах FEI Krios, FEI Talos Arctica и JEOL CRYOARM300 с камерами Gatan K2, FEI Falcon II и FEI Falcon III DDD в обоих режимах сверхвысокого разрешения (K2). и режимы счета и на многих уровнях расфокусировки. Включение нескольких микроскопов, камер и наборов данных позволяет моделировать надежные параметры шумоподавления в обычных установках микроскопов.

Мы формируем два общих агрегированных набора данных, один из которых мы называем «Большой», а другой — «Малый».«Большой» набор данных содержит микрофотографии всех отдельных наборов данных. Чтобы примерно сбалансировать вклад отдельных наборов данных в эти совокупные наборы данных, мы случайным образом выбираем для включения до 200 микрофотографий из каждого отдельного набора данных, а не все микрофотографии. Небольшой набор данных содержит микрофотографии из отдельных наборов данных, выбранных на глаз на основе характеристик шумоподавления индивидуально обученных моделей шумоподавления U-net.

Структура Noise2Noise требует парных зашумленных наблюдений одного и того же базового сигнала.Мы генерируем эти пары, разделяя кадры микрофотографии на четные / нечетные кадры, которые представляют собой независимые наблюдения. Эти четные / нечетные кадры микрофотографии затем суммируются напрямую, чтобы сформировать парные наблюдения. Поскольку микрофотографии обычно корректируются движением перед суммированием, и эта процедура коррекции движения может изменить распределение шума микрофотографий, мы также формируем выровненные, суммированные пары микрофотографий, выравнивая четные / нечетные кадры микрофотографии с MotionCor2 ³⁴, используя 5 на 5 фрагментов и b-фактор 100.В результате было получено 1929 парных микрофотографий для Малого набора данных и 3439 парных микрофотографий для Большого набора данных.

Архитектура модели

Мы принимаем архитектуру модели U-Net ³⁵, аналогичную той, которую использовали Lehtinen et al. ⁹, за исключением того, что входные и выходные карты характеристик являются одномерными ( n = 1 для соответствия монохромным микрофотографиям), и мы заменяем первые два сверточных слоя шириной 3 по Lehtinen et al. с одинарным сверточным слоем шириной 11 (дополнительный рис.19) аналогично другим сверточным нейронным сетям, используемым в cryoEM ¹⁶. Эта модель содержит пять максимальных объединяемых блоков понижающей дискретизации и пять блоков повышающей дискретизации ближайшего соседа с пропускаемыми соединениями между блоками понижающей и повышающей дискретизации при каждом пространственном разрешении. Мы называем это моделью U-net. Для сравнения мы также рассматриваем меньшую модель U-net только с 3 блоками понижающей и повышающей дискретизации, которую мы называем моделью U-net (small). Мы также сравниваем с полностью сверточной нейронной сетью, состоящей из трех сверточных слоев шириной 11 × 11 с 64 фильтрами каждый и активацией линейных блоков с утечкой выпрямления, называемой FCNN, и аффинной моделью с одним сверточным фильтром шириной 31 × 31.

Функции потерь и структура Noise2Noise

Структура Noise2Noise использует преимущество наблюдения, что мы можем изучать модели, которые восстанавливают статистику распределения шума при парных зашумленных наблюдениях одного и того же базового сигнала. Учитывая наземный истинный сигнал, y , мы наблюдаем изображения этого сигнала, которые были искажены некоторым вероятностным шумовым процессом, x ~ Шум ( y ). Учитывая парные зашумленные наблюдения для согласованных сигналов, x _a ~ Шум ( y ) и x _b ~ Шум ( y ), мы можем изучить функцию, которая восстанавливает статистику этого распределения.Это достигается путем нахождения параметров функции шумоподавления, f с параметрами θ , так что ошибка между шумоподавленным отсчетом f ( x _a) и необработанным x _b свернуты. Форма этой функции ошибок определяет, какую статистику распределения шума мы учимся восстанавливать. Дан набор данных X , содержащий множество таких пар изображений, минимизирующий ошибку L2 по парным выборкам,

$$ {\ mathrm {argmin}} _ \ theta \, E_ {x_z, x_b \ sim X} [|| f (x_a) — x_b || _2 ^ 2], $$

(1)

находит f со средним поиском.Минимизация ошибки L1 по парным выборкам,

$$ {\ mathrm {argmin}} _ \ theta \, E_ {x_z, x_b \ sim X} [|| f (x_a) — x_b || _1], $$

(2)

находит f с поведением поиска медианы. Наконец, минимизируя ошибку L0 по парным выборкам,

$$ {\ mathrm {argmin}} _ \ theta \, E_ {x_z, x_b \ sim X} [|| f (x_a) — x_b || _0], $ $

(3)

находит f с поиском режима.Эта последняя цель недифференцируема и требует сглаживания для минимизации стандартным градиентным спуском. Мы отсылаем читателя к Lehtinen et al. ¹¹ для получения подробной информации об этой цели обучения. На практике для обучения используются ошибки шумоподавления как x _a, так и x _b.

Подробности обучения

Для нейронных сетей веса инициализируются с использованием инициализации по умолчанию в PyTorch ³⁶.Для аффинных моделей веса инициализируются нулем. Все модели обучаются с использованием варианта стохастического градиентного спуска Адаграда ²⁴ со скоростью обучения 0,001 для 100 эпох. Мы обучаем на участках размером 800 на 800, случайным образом выбираемых из каждой микрофотографии, используя размер мини-пакета, равный 4. По мере увеличения данных эти участки случайным образом вращаются и зеркально отражаются. Чтобы избежать артефактов интерполяции, изображения поворачиваются только на 90 °, 180 ° или 270 °. Изображения сначала нормализуются на уровне всей микрофотографии путем вычитания средней интенсивности пикселей и деления на стандартное отклонение интенсивностей пикселей.Модели обучались на одном графическом процессоре NVIDIA V100 с 32 ГБ видеопамяти. Обучение длилось около 15 часов на модель.

Сведения о выводе

Учитывая обученную модель шумоподавления, мы удаляем полноразмерные микрофотографии. При работе с графическим процессором ограничения ОЗУ могут потребовать выполнения шумоподавления в виде исправлений. Здесь мы делаем шумоподавление фрагментами размером 4000 на 4000 пикселей. Чтобы избежать артефактов, которые могут возникать по краям патча при сшивании, мы включаем отступ в 500 пикселей вокруг каждого патча при шумоподавлении.Мы отмечаем, что этот подход с заполнением идеально разрешает эффекты края патча, когда заполнение составляет по крайней мере половину воспринимающего поля модели. Целые микрофотографии сначала нормализуются путем вычитания среднего и деления на стандартное отклонение интенсивностей пикселей. Интенсивность пикселей уменьшенной микрофотографии затем восстанавливается путем умножения на стандартное отклонение и добавления среднего значения. Учитывая обученную модель шумоподавления, вывод происходит быстро. Мы можем уменьшить шум изображения 4k на 4k K2 со скоростью ~ 3 с / микрофотографию на одном NVIDIA 1080 Ti.

Масштабирование микрофотографии для визуализации фигуры

Чтобы правильно масштабировать интенсивность пикселей между необработанными и очищенными микрофотографиями для визуализации, мы масштабируем каждую микрофотографию относительно интенсивностей микрофотографии с 16-кратной фильтрацией нижних частот. Это достигается путем вычитания среднего значения и деления на стандартное отклонение интенсивностей пикселей на микрофотографии, отфильтрованной нижними частотами. Это гарантирует, что относительные уровни сигналов идентичны для всех обработанных версий микрофотографии.Кроме того, чтобы преобразовать их в 256-битные значения для отображения, мы объединяем интенсивность пикселей вещественного числа в равномерно распределенные сегменты от -4 до 4.

Количественное определение отношения сигнал / шум

Мы количественно оцениваем SNR необработанных микрофотографий и обработанных микрофотографий. двумя способами: (1) на основе парных помеченных областей сигнала и фона и (2) с использованием двух независимых измерений одного и того же сигнала. Для первого метода мы вручную пометили 20 сигнальных и парных фоновых областей на 10 микрофотографиях из каждого набора данных.i),} $$

(4)

, который сообщается для каждого набора данных с использованием необработанных микрофотографий и микрофотографий с шумоподавлением. Это эквивалентно десятикратному логарифму отношения сигнал / шум. Мы сообщаем SNR таким образом для согласования с литературой по шумоподавлению.

Для второго, независимого метода вычисления SNR мы применяем подход Франка и Аль-Али ²⁷, в котором SNR оценивается по двум независимым измерениям одного и того же сигнала с использованием соотношения SNR = p / (1 — p ), где p — коэффициент взаимной корреляции между двумя измерениями.Мы используем это для измерения отношения сигнал / шум шумоподавления путем разделения микрофотографий на четные и нечетные кадры, выравнивания каждого кадра независимо, удаления шума на микрофотографии нечетного кадра и затем вычисления корреляции между шумоподавленной микрофотографией нечетного кадра и необработанной микрофотографией четного кадра. Исходя из этого, мы сообщаем SNR в дБ как

$$ {\ mathrm {SNR}} = 10 {\ mathrm {log}} _ {10} (p / (1 — p)) $$

(5)

, где p теперь является взаимной корреляцией между шумоподавленной микрофотографией нечетного кадра и необработанной микрофотографией четного кадра.Преимущество этого расчета отношения сигнал / шум по сравнению с нашей оценкой, приведенной выше, заключается в том, что он учитывает все пиксели на микрофотографии и не требует маркировки сигнальных и фоновых областей. Недостатком является то, что он требует парных измерений и, следовательно, может быть рассчитан только для наборов данных, в которых у нас есть необработанные кадры. Мы также не можем рассчитать ОСШ полной микрофотографии.

Количественная оценка отношения сигнал / шум для криоэлектронных томограмм выполняется с использованием второго метода, при котором субобъем размером ~ 1000 × 1000 × 150 пикселей каждой томограммы, содержащей биологические объекты, используется для расчета отношения сигнал / шум.

Обработка микрофотографий с короткой экспозицией

Чтобы количественно оценить нашу способность улучшить интерпретируемость микрофотографий с низкой дозой электронов, мы выбрали от пяти до десяти случайных микрофотографий для четырех представленных наборов данных (EMPIAR-10234, 18sep08d, 19jan04d и 19may10e). Микрофотографии из каждого набора данных были разделены на пять разделенных по кадрам подмножеств с использованием программы IMOD newstack ³⁷ для моделирования коротких выдержек: 10%, 25%, 50%, 75% и 100%. Рамки были выровнены с помощью Motioncor2 с использованием пластырей 5 × 5 и взвешивания дозы.Для каждого набора данных количественная оценка SNR была выполнена с использованием второго метода, описанного выше. Для этой количественной оценки микрофотографии были разделены на четные и нечетные кадры. Затем нечетные кадры фракционировали по дозам на 10%, 17,5%, 25%, 37,5% и 50% от общих доз на полной микрофотографии (округленные до ближайшего кадра) и подавляли шум. Эти снимки с шумоподавлением при низкой дозе сравнивали с соответствующими снимками с четным кадром при полной дозе для расчета отношения сигнал / шум. На полной микрофотографии общие дозы для EMPIAR-10234, 18sep08d, 19jan04d и 19may10e составляют 67.12 e- / Å ², 39,6 e- / Å ², 69,46 e- / Å ² и 64,44 e- / Å ², соответственно.

Обработка апоферритина с короткой экспозицией

Для количественной оценки последующих результатов титрования по кадрам с использованием Motioncor2 без взвешивания дозы были подготовлены 100 случайных независимо выровненных по кадрам фракционированных микрофотографий 19jan04d. Оценка CTF полученных 500 микрофотографий с выравниванием по кадрам была выполнена с использованием CTFFind4 ³⁸ из Appion ²⁰.9 373 частицы были взяты из микрофотографий с использованием первых 10% кадров (первые 1 с экспозиций), исходная модель была создана в CryoSPARC, и частицы были очищены путем гомогенного уточнения с использованием «золотого стандарта» FSC. Затем те же самые отборы частиц и исходная модель были использованы для извлечения и обработки 25%, 50%, 75% и 100% подмножеств с помощью гомогенного уточнения de novo 3D с использованием «золотого стандарта» FSC с сохранением каждой независимой оценки CTF на микрофотографиях. 3DFSC ^{39 Затем на основе результатов было построено 39} графиков.

Оптимизированный тест времени воздействия Krios K2, K3

Для количественной оценки воздействия на время сбора с использованием доз облучения, оптимизированных с помощью Topaz-Denoise, мы организовали несколько сеансов сбора на системах FEI Titan Krios + Gatan K2 и FEI Titan Krios + Gatan K3 под управлением Leginon коллекция. Для каждой системы мы использовали сетку апоферритина с интервалом 1,2 / 1,3 отверстий, 300 меш и собрали четыре набора данных для имитации общих параметров сбора: один с одной нормальной экспозицией (~ 66 e- / Å ²) и одним фокусом на отверстие, один с одной оптимизированной экспозицией (~ 17 e- / Å ²) и одним фокусом на отверстие, один с четырьмя нормальными экспозициями (~ 66 e- / Å ²) и одним фокусом на отверстие, и один с четырьмя оптимизированными экспозициями (~ 17 э- / Å ²) и один фокус на отверстие.В системе K2 нормальные экспозиции занимали 10 с, а оптимизированные — 2,5 с. В системе K3 нормальная экспозиция заняла 2,5 с, а оптимизированная — 0,65 с. Перед съемкой каждой экспозиции столик устанавливали на 1 с. Сбор для каждого условия длился 20-30 минут, чтобы учесть среднее время, затрачиваемое на сбор данных (фокусировка, перемещение сцены, считывание камеры и т. Д.). Затем время сбора экстраполировалось на экспозицию в час и экспозицию в день. Дополнительные накладные расходы, такие как повторное заполнение LN2 и нацеливание на оптимальные области пробы, не были приняты во внимание.

Обработка кластеризованного протокадгерина EMPIAR-10234 с единичными частицами

Мы обработали набор данных кластеризованного протокадгерина EMPIAR-10234 двумя разными способами, чтобы проверить, была ли выборка на микрофотографиях с шумоподавлением преимуществом: во-первых, с использованием выборок частиц, предоставленных владельцем данных, и во-вторых вручную выбирая микрофотографии с шумоподавлением.

Метод выбора, используемый владельцем данных, описан в Brasch et al. ²⁵ Вкратце, 1540 частиц были вручную отобраны владельцем данных из 87 необработанных микрофотографий и использованы для обучения модели отбора Topaz ¹⁶, в результате чего было получено 14 569 частиц.Следующий рабочий процесс реконструкции был выполнен в CryoSPARC v2 ¹⁸ с использованием симметрии C1 на каждом этапе и с использованием суммированных по кадрам частиц для единообразия. Двухмерная классификация была выполнена три раза для удаления очевидных классов, не относящихся к частицам, в результате получилось 13 739 частиц. Реконструкция ab initio с двумя классами была выполнена, в результате был получен один хороший класс с 10 010 частицами. Трехмерное однородное уточнение с использованием «золотого стандарта» FSC привело к окончательной реконструкции.

Метод пикировки, который мы использовали, следующий: микрофотографии с суммированием кадров были деноминированы с помощью Topaz-Denoise v0.2.1 Модель L2, обработанная с помощью «предварительной обработки топаза» при биннинге в 4 раза, и 1023 частицы были выбраны вручную не владельцем данных из 215 шумоподавленных микрофотографий. Модель захвата Topaz ¹⁶ была обучена с использованием координат частиц на необработанных микрофотографиях, в результате было получено 59 273 частицы. Следующий рабочий процесс реконструкции был выполнен в CryoSPARC v2 с использованием симметрии C1 на каждом этапе и с использованием суммированных по кадрам частиц для единообразия. Двухмерная классификация была проведена три раза, чтобы удалить очевидные классы, не относящиеся к частицам, в результате чего было получено 44 303 частицы.Была проведена реконструкция ab-initio с двумя классами, в результате чего был получен один хороший класс с 23 695 частицами. Было выполнено неоднородное уточнение с двумя классами, в результате чего были получены два класса с разными конформациями. Была проведена двухмерная классификация и гетерогенное уточнение с этими двумя классами и классом мусора, в результате чего было получено 13 392 частицы в закрытой конформации и 8134 частицы в частично открытой конформации. Трехмерное однородное уточнение с использованием «золотого стандарта» FSC было выполнено для каждого класса, что привело к окончательной реконструкции.UCSF Chimera ⁴⁰ использовался для визуализации окончательных реконструкций.

Обработка одной частицы с кластеризованным протокадгерином с низким числом частиц

Удаление шумов и сборка выполнялись, как описано в последнем абзаце предыдущего раздела. Затем были выбраны 1000 случайных частиц и обработаны с помощью реконструкции из первых принципов CryoSPARC v2 шесть раз с использованием необработанных частиц и шесть раз с использованием частиц, обозначенных моделью v0.2.1 L2. Сравнение полной 3D-карты и каждого набора из шести ab initio моделей было выполнено в UCSF Chimera ⁴⁰.

Криоэлектронная томография и 3D шумоподавление

Saccharomyces uvarum ( S.uvarum ) выращивали до логарифмической фазы в среде YPD, наносили на свежеотверждаемые угольные / медные сетки Quantifoil 200 меш, обратно промокали с помощью Leica GP , и окунуться в жидкий этан. Сетки были обрезаны и загружены в двойной луч Helios NanoLab 650. Протокол фрезерования ⁴¹ давал ламели толщиной от ~ 100 до 150 нм. Вкратце, дрожжевые клетки замораживали после обратного блоттинга с использованием FEI Vitrobot, проводящий слой платины наносили на криостадию Quorum, наносили защитный слой платинового GIS, FIB-измельчение выполняли в FEI Helios NanoLab 650, и последний слой проводящей платины был нанесен на ламели.Томограммы были получены с помощью FEI Titan Krios, оснащенного энергетическим фильтром, и Gatan K2 BioQuantum, работающего в режиме счета со следующими параметрами: энергетический фильтр, щель 30 эВ, расфокусировка ~ 18 мкм, размер пикселя 6,08 Å, наклон от -48,0 ° до 48,0 ° с с шагом 2 °, общая доза ~ 60 э- / Å ². Томограммы собирались по двунаправленной схеме с невыпущенным гибридным методом отслеживания / прогнозирования ⁴², реализованным в Leginon ⁴³. Необработанные кадры были выровнены с помощью MotionCor2 ³⁴ и разбиты на четные / нечетные пары перед суммированием.Целые серии наклона были выровнены с помощью Appion-Protomo ^44,45, затем разделены на серии наклона четных / нечетных кадров и реконструированы с помощью взвешенной обратной проекции Tomo3D ^46,47, давая четные / нечетные половинные томограммы. Для обучения использовались тридцать две томограммы клеточной и восстановленной среды, полученные на системах FEI Titan Krios + Gatan K2 BioQuantum со средним размером пикселя 5,2 Å (диапазон: 1,8–6 Å) и расфокусировкой 9 мкм (диапазон: 4–18 мкм). предварительно обученные общие модели шумоподавления, которые выполнялись параллельно на семи графических процессорах Nvidia GTX 1080.Обучение модели для томограмм с разбивкой по двум (Unet-3d-10a) заняло более одного месяца, а обучение модели для томограмм с интервалом по четыре (Unet-3d-20a) заняло десять дней. Удаление шумов на томограмме объемом 3 ГБ, разделенной на два, занимает около пяти минут на графическом процессоре Nvidia RTX Titan и графическом процессоре Nvidia RTX 2080 Ti одновременно. Рисунки для томографии и дополнительные фильмы были сделаны с использованием Imod ³⁷.

Модель шумоподавления томограммы использует архитектуру U-net, идентичную 2D U-сети, представленной выше, за исключением того, что 2D-свертки заменены на 3D-свертки для работы с сетками вокселей томограммы, а ширина первого сверточного ядра составляет 7 вокселей, а не 11.В остальном методы обучения и вывода идентичны, за исключением размера патча, который установлен на 96, чтобы томограммы поместились в ОЗУ графического процессора.

№	Наименование	Значение
1	УОСВ «Топас» 4-40 (отдельный автомат. выключатель)	10 Ам
2	УОСВ «Топас» 50-150 (отдельный автомат. выключатель)	16 Ам

№	Наименование	Значение
1	Рекомендуемый кабель при расстоянии до 30м	ВБбШвнг 4х1,5 кв
2	Рекомендуемый кабель при расстоянии с 30м до 80м	ВБбШвнг 4х2,5 кв
3	Рекомендуемый кабель при расстоянии более 80м	ВБбШвнг 4х4 кв